Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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CNGA3Q16281 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
CNGA3Q16281 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
CNGA3Q16281 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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