Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
USF2Q15853 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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