Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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