Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
HERC3Q15034 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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