Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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UBE4AQ14139 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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UBE4AQ14139 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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UBE4AQ14139 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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UBE4AQ14139 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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UBE4AQ14139 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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UBE4AQ14139 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
UBE4AQ14139 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
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UBE4AQ14139 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
UBE4AQ14139 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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