Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC112496.1-201ENST00000497961 562 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SPTAN1Q13813 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SPTAN1Q13813 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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