Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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SHROOM2Q13796 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
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SHROOM2Q13796 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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SHROOM2Q13796 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SHROOM2Q13796 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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