Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
APOFQ13790 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
APOFQ13790 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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APOFQ13790 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
APOFQ13790 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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