Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CDH18Q13634 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
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