Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CUL4BQ13620 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms