Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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