Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TCIRG1Q13488 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TCIRG1Q13488 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TCIRG1Q13488 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TCIRG1Q13488 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AP001432.1-201ENST00000440629 520 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCIRG1Q13488 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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