Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
XRCC4Q13426 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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