Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PMS2P3Q13401 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms