Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PDE3BQ13370 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PDE3BQ13370 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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