Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
SGCGQ13326 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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