Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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