Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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TRAF3Q13114 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TRAF3Q13114 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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TRAF3Q13114 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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TRAF3Q13114 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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TRAF3Q13114 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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TRAF3Q13114 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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TRAF3Q13114 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TRAF3Q13114 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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