Protein–RNA interactions for Protein: Q13107

USP4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4Q13107 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
USP4Q13107 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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USP4Q13107 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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USP4Q13107 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
USP4Q13107 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
USP4Q13107 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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