Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
ACACAQ13085 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ACACAQ13085 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms