Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
BPTFQ12830 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
BPTFQ12830 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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