Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
GTF3C1Q12789 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
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GTF3C1Q12789 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GTF3C1Q12789 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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