Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
COPS7AQ9UBW8 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
COPS7AQ9UBW8 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms