Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CLPPQ16740 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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