Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NRF1Q16656 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms