Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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