Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
CCDC85BQ15834 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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