Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HERC1Q15751 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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