Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SS18Q15532 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SS18Q15532 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SS18Q15532 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SS18Q15532 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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