Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
RYR3Q15413 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms