Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU4-49P-201ENST00000516080 140 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms