Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
HERPUD1Q15011 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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