Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
GPNMBQ14956 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms