Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
CNGB1Q14028 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms