Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CKAP5Q14008 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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