Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CCINQ13939 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CCINQ13939 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CCINQ13939 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms