Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ALCAMQ13740 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms