Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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