Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
AP3B2Q13367 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
AP3B2Q13367 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms