Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
ATMQ13315 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
ATMQ13315 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
ATMQ13315 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATMQ13315 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATMQ13315 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATMQ13315 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
ATMQ13315 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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