Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
CALCOCO2Q13137 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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CALCOCO2Q13137 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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CALCOCO2Q13137 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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CALCOCO2Q13137 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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CALCOCO2Q13137 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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CALCOCO2Q13137 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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CALCOCO2Q13137 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
CALCOCO2Q13137 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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