Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
DUSP4Q13115 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms