Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms