Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CSTF3Q12996 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSTF3Q12996 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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