Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
RBBP4Q09028 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms