Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms