Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PTPRMP28827 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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PTPRMP28827 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTPRMP28827 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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PTPRMP28827 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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PTPRMP28827 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPRMP28827 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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