Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
SMG1Q96Q15 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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