Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 ST3GAL3-233ENST00000531816 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 OR51K1P-201ENST00000510214 950 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
C4orf17Q53FE4 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms