Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
IMPG1Q17R60 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
IMPG1Q17R60 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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